Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSDA5PKW4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms