Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms