Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP3Q9Y6F1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PARP3Q9Y6F1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP3Q9Y6F1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP3Q9Y6F1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP3Q9Y6F1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP3Q9Y6F1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP3Q9Y6F1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP3Q9Y6F1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP3Q9Y6F1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms