Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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HCN4Q9Y3Q4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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HCN4Q9Y3Q4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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HCN4Q9Y3Q4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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