Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM35Q9UPQ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms