Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCG2Q9UNQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ABCG2Q9UNQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCG2Q9UNQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCG2Q9UNQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms