Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GGA2Q9UJY4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA2Q9UJY4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms