Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00527Q9UJ94 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00527Q9UJ94 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00527Q9UJ94 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00527Q9UJ94 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00527Q9UJ94 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00527Q9UJ94 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00527Q9UJ94 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms