Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPP1R1BQ9UD71 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R1BQ9UD71 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms