Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3BQ9UBC3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms