Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SCHIP1Q9P0W5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms