Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC59Q9P031 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms