Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23BQ9NYZ1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23BQ9NYZ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23BQ9NYZ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23BQ9NYZ1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23BQ9NYZ1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23BQ9NYZ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23BQ9NYZ1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms