Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RDH8Q9NYR8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms