Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms