Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms