Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB4Q9NTQ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB4Q9NTQ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms