Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRIP3Q9NQ35 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms