Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms