Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L4AQ9HCS5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms