Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NBPF3Q9H094 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBPF3Q9H094 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms