Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms