Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms