Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF4Q9BZC1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms