Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms