Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms