Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP3Q9BWW4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP3Q9BWW4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms