Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKNK1Q9BUB5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms