Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAGR1Q9BTK6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms