Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HDHD3Q9BSH5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HDHD3Q9BSH5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms