Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD9AQ99638 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms