Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAT1Q99536 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms