Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD1Q99460 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms