Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP5Q96RT8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms