Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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