Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms