Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC115Q96NT0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms