Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1Q96NA8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms