Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCMTD1Q96MG8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms