Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms