Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF496Q96IT1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF496Q96IT1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms