Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO1Q92973 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO1Q92973 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms