Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms