Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DTX3LQ8TDB6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms