Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms