Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms