Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LINC00116Q8NCU8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms