Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATD1Q8NB37 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms