Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms