Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C15orf54Q8N8G6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C15orf54Q8N8G6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms